Впервые герб у города Шенкурска появился в 1780 году. На нем в верхей части был изображен Вологодский герб (выходящая из серебряных облаков десница в золотом одеянии, держащая золотую державу и серебряный меч с золотым эфесом), а в нижней – барсук в зеленом поле.
В 2009 году Шенкурскому району исполнилось 80 лет. К этому событию «Шенкурский муниципальный район» получил свой герб. Вот как выглядит описание герба: «В зеленом поле идущий серебряный с черными глазами, носом, полосой на морде, брюхом и лапами барсук. В вольной части герб Архангельской области. Щит увенчан муниципальной короной установленного образца». Новый герб города Шенкурск был создан на основе герба, который был утвержден 2 октября 1781 года. Символику Шенкурска расшифровывают так. Барсук – местный зверек, который в большом количестве обитает окрестностях города. Зеленый цвет – это символ изобилия, плодородия, радости, мира. Серебро обозначает веру, чистоту, искренность, благородство и откровенность. Черный цвет – цвет образованности и скромности. А герб Архангельской области обозначает территориальную принадлежность.